11
Εικόνα 1.
Ηλεκτροφόρηση προϊόντων PCR σε πήκτωμα αγαρόζης 1,2%. LAD: DNA ladder, oι αριθμοί στις
παρενθέσεις αντιστοιχούν στον αριθμό σποριαγγείων του
Synchytrium endobioticum
που χρησιμοποιήθηκε για
εκχύλιση DNA, S(+): θετικός μάρτυρας-DNA
S. endobioticum
, H
2
O: αρνητικός μάρτυρας, R: αρνητικός μάρτυρας-
FastGene Direct PCR Kit με DNAreleasy.
Το Eργαστήριο Μυκητολογίας συμμετείχε, μετά από σχετική πρόσκληση, σε διεργαστηριακή δοκιμή
επάρκειας (Proficiency Interlaboratory Test) Εργαστηρίων των Κρατών-μελών της Ε.Ε. που διοργανώθηκε
από το ΑNSES-Laboratoire de la Santé des Végétaux, Unité de Mycologie της Γαλλίας την περίοδο
Νοέμβριος-Δεκέμβριος 2015, με θέμα “Detection of
Phytophthora ramorum
using conventional PCR
technique according to the French official method MOA 018, part B, version 1a or any other equivalent
method”. Σκοπός της διεργαστηριακής δοκιμής ήταν η αξιολόγηση της ικανότητας των συμμετεχόντων
Εργαστηρίων να ανιχνεύσουν με τη χρήση της μεθόδου PCR την παρουσία του φυτοπαθογόνου μύκητα
καραντίνας
P. ramorum
απ’ ευθείας σε ιστούς συμπτωματικών φυτών-ξενιστών του γένους
Rhododendron
.
Στη διεργαστηριακή δοκιμή, συμμετείχαν συνολικά οκτώ (8) Εργαστήρια (Αναφοράς, Επίσημα και άλλα)
της Ε.Ε. Τα αποτελέσματα της διεργαστηριακής δοκιμής για το Εργαστήριο Μυκητολογίας έδειξαν 100%
συμφωνία ως προς τα κριτήρια αξιολόγησης της ευαισθησίας (sensitivity), ειδικότητας (specificity),
ακρίβειας (accuracy) και επαναληψιμότητας (repeatability) της μεθόδου PCR των Ioos
et al
. (2006), που
εφαρμόσθηκε από το Εργαστήριο. Παράλληλα και ανεξάρτητα από τη διαδικασία της διεργαστηριακής
δοκιμής, πραγματοποιήθηκαν δοκιμές και άλλων δημοσιευμένων μεθόδων PCR, όπως των Lane
et
al.
(2003), Drenth
et
al
. (2006), και White
et
al
. (1990) με χρήση των ίδιων δειγμάτων, για σύγκριση των
μεθόδων αυτών ως προς τα ίδια κριτήρια αξιολόγησης.
Το
Εργαστήριο Βακτηριολογίας
του Μ.Φ.Ι., στο πλαίσιο του εν λόγω Προγράμματος,
διενήργησε 2190 εργαστηριακές εξετάσεις σε 1634 δείγματα φυτών και φυτικών προϊόντων από
καθορισμένες καλλιέργειες της χώρας, τα οποία στάλθηκαν από τους Φυτοϋγειονομικούς Ελεγκτές
κατά το έτος 2015, για τον έλεγχο παρουσίας ή μη προκαρυωτικών φυτοπαθογόνων (βακτηρίων,
φυτοπλασμάτων) καραντίνας, σύμφωνα με την ισχύουσα Εθνική και Κοινοτική νομοθεσία για την
φυτοϋγεία. Τα προκαρυωτικά φυτοπαθογόνα για τα οποία πραγματοποιούνται οι έλεγχοι είναι δεκατρία
(13) συνολικά, οκτώ (8) βακτήρια και πέντε (5) φυτοπλάσματα και έχουν ως εξής :
1.
Ralstonia solanacearum
2.
Clavibacter michiganensis
subsp.
sepedonicus
3.
Erwinia amylovora
4.
Curtobacterium flaccumfaciens
pv.
flaccumfaciens
5.
Xanthomonas axonopodis
pv.
phaseoli
6.
Xylella fastidiosa
7.
Pseudomonas syringae
pv.
actinidiae
8.
Clavibacter michiganensis
subsp.
insidiosus
9. Potato stolbur phytoplasma
10.
Spiroplasma citri
11.
Candidatus
Phytoplasma mali
LAD
(1) (5) (10) (50) S (+) H
2
O LAD
(1) (5) (10) (50) R S (+) H
2
O
α β
