Page 103 - 2010-2011

102
Εικόνα 1. Πιθανές νησίδες του εκκριτικού συστήματος VI των παθότυπων του γένους Pseudomonas syringae. Οι
νησίδες προέκυψαν από αναγωγή και σύγκριση με τα στελέχη DC3000 και T1 του P. syringae pv. tomato, P.s. pv.
syringae στέλεχος B728a, P.s. pv. phaseolicola στέλεχος 1448a, P.s. pv. tabaci στέλεχος ATCC 11528 και P.s.
pv. oryzae στέλεχος 1_6. Τα ορθόλογα γονίδια (υποδεικνύονται με τα ίδια χρώματα) βασίζονται στο BLASTP E-
value of <e10 ή σε προ-δημοσιευμένη πληροφορία. Γονίδια σχετιζόμενα με τις νησίδες αλλά όχι αναγνωρισμένα
ως ορθόλογα υποδεικνύονται με γκρι χρώμα. Τα βέλη υποδεικνύουν μεταγραφική κατεύθυνση. Σε κάθε νησίδα το
τετραψήφιο νούμερο της γονιδιακής περιοχής (locus number) αναφέρεται μόνο στο ακραίο εκ των αριστερών
γονίδιο και στα υπόλοιπα γονίδια μόνο το διψηφίο νούμερο που αντιστοιχέι στην ίδια περιοχή (Iocus). Προ-
δημοσιευμένοι κωδικοί-ταυτότητες γονιδίων ή/και πρωτεϊνών τους αναγράφονται κάτω από τα αντίστοιχα γονίδια.