Page 99 - 2010-2011

98
επιλέχθηκαν δύο ζεύγη εκκινητών, οι οποίοι δοκιμάστηκαν επιτυχώς στο Εργαστήριο σε εκχυλίσματα DNA
από μολυσμένα με τα ως άνω παθογόνα φυτά, τα οποία αποκτήθηκαν από το Ερευνητικό Ινστιτούτο
‘Austrian Agency for Health and Food Safety’ (AGES). Τα ως άνω DNA εκχυλίσματα θα χρησιμοποιηθούν
ως ‘θετικοί μάρτυρες’ για εργαστηριακούς ελέγχους φυτικού υλικού. Κατά το έτος 2011, διερευνήθηκε η
δυνατότητα χρησιμοποίησης εξειδικευμένων εκκινητών για την ανίχνευση με τη μέθοδο PCR του
φυτοπλάσματος: Grapevine flavescence dorée, σε δείγματα αμπέλου. Η μέθοδος που εφαρμόστηκε
προτείνεται από τον Ευρωπαϊκό και Μεσογειακό Οργανισμό Προστασίας Φυτών (European and
Mediterranean Plant Protection Organization, EPPO) και περιλαμβάνει τη χρήση ενός ζεύγους ‘γενικών’
(generic) εκκινητών για τα φυτοπλάσματα σε πρώτο στάδιο, και ενός ζεύγους εξειδικευμένων εκκινητών για
την ομάδα των φυτοπλασμάτων Εlm yellows, στην οποία ανήκει το Grapevine flavescence dorée, σε
δεύτερο στάδιο. Ως θετικός μάρτυρας χρησιμοποιήθηκε εμπορικά διαθέσιμο εκχύλισμα DNA της
μελετώμενης ομάδας των φυτοπλασμάτων. Η μέθοδος εφαρμόστηκε σε δείγματα φύλλων αμπέλου από
περιοχή της Αργολίδας με ύποπτα συμπτώματα προσβολής από το εν λόγω φυτόπλασμα. Σε κανένα από
τα δείγματα δεν ανιχνεύτηκε DNA του φυτοπλάσματος Flavescence dorée. Τα δείγματα ελέγχθηκαν και με
δεύτερη μέθοδο PCR, η οποία βασίζεται στη χρήση ενός διαφορετικού ζεύγους ‘γενικών’ για τα
φυτοπλάσματα εκκινητών, την επακόλουθη πέψη του προϊόντος της PCR με ενδονουκλεάσες
περιορισμού, και τη σύγκριση των προϊόντων της πέψης με εκείνα των θετικών μαρτύρων. Τα
αποτελέσματα και της δεύτερης μεθόδου ήταν αρνητικά ως προς την ανίχνευση του φυτοπλάσματος στα
δείγματα φύλλων αμπέλου.
ΤΜΗΜΑ Φυτοπαθολογίας
ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΟ Βακτηριολογίας
ΥΠΕΥΘΥΝΟΣ ΕΡΓΟΥ Δρ Μ.Κ. Χολέβα
ΕΜΠΛΕΚΟΜΕΝΟ ΠΡΟΣΩΠΙΚΟ Π.Ε. Γλυνός, Χ. Καράφλα, Σ.
Δρακούλης
ΔΙΑΡΚΕΙΑ ΕΡΓΟΥ (ΕΝΑΡΞΗ - ΛΗΞΗ) 2010-2012
Π ΗΓΗ ΧΡΗΜΑΤΟΔΟΤΗΣΗΣ ΜΦΙ
1.3.1.10 Απομόνωση και ταυτοποίηση φυτοπαθογόνων βακτηρίων και μυκήτων από
δείγματα κονδύλων πατατοσπόρου με σήψεις.
Κατά το 2010 συνεχίστηκε και ολοκληρώθηκε, το πρόγραμμα εξέτασης δειγμάτων κονδύλων
πατάτας (κυρίως πατατόσπορου) με συμπτώματα υγρών ή ξηρών σήψεων, που αποστέλλονταν από
την εταιρεία Agrocom S.A., μέσω της Μπενακείου Φυτοπαθολογικής Εταιρείας, στα Εργαστήρια
Βακτηριολογίας και Μυκητολογίας του Μ.Φ.Ι. Από τη συγκέντρωση των αποτελεσμάτων των
εργαστηριακών ελέγχων που διενεργήθηκαν καθόλη τη διάρκεια του προγράμματος (2008-2010)
προέκυψε ότι τα κύρια προβλήματα σήψεων των κονδύλων πατάτας που εξετάστηκαν αφορούσαν
βακτηριολογικές προσβολές από πηκτινολυτικά βακτήρια που ευθύνονταν για τη δημιουργία
μαλακών/υγρών σήψεων των κονδύλων και συγκεκριμένα τα: Pectobacterium carotovorum subsp.
carotovorum (συν. Erwinia carotovora subsp. carotovora ), Pectobacterium atrosepticum (συν. Erwinia
carotovora subsp. atroseptica), Dickeya spp. (συν. Erwinia chrysanthemi ) Η ταυτοποίηση των ως άνω
παθογόνων μικροοργανισμών βασιζόταν σε μορφολογικούς και βιοχημικούς χαρακτήρες τους και,
εφόσον κρινόταν αναγκαία, γινόταν εφαρμογή ορολογικών και μοριακών τεχνικών διάγνωσης.
ΤΜΗΜΑ Φυτοπαθολογίας
ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΟ Βακτηριολογίας, Μυκητολογίας
ΥΠΕΥΘΥΝΟΣ ΕΡΓΟΥ Δρ Μ.Κ. Χολέβα
ΕΜΠΛΕΚΟΜΕΝΟ ΠΡΟΣΩΠΙΚΟ Δρ Δ. Λάσκαρης, Χ. Καράφλα, Π.Ε.
Γλυνός, Σ. Δρακούλης, Σ. Μιγκάρδου
ΔΙΑΡΚΕΙΑ ΕΡΓΟΥ (ΕΝΑΡΞΗ - ΛΗΞΗ) 21.02.2008 - 21.02.2010