Page 52 - ektheseis 2012

50
ΤΜΗΜΑ Εντομολογίας και Γεωργικής Ζωολογίας
ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΟ Νηματωδολογίας
ΥΠΕΥΘΥΝΟΣ ΕΡΓΟΥ Μαρία Κορμπή, Δρ Ν.Γ. Καβαλλιεράτος
ΕΜΠΛΕΚΟΜΕΝΟ ΠΡΟΣΩΠΙΚΟ ΑΠΟ ΤΟ ΜΦΙ Γεώργιος Ζυγούρης
ΔΙΑΡΚΕΙΑ ΕΡΓΟΥ 20.04.2012 - 20.12.2012
ΠΗΓΗ ΧΡΗΜΑΤΟΔΟΤΗΣΗΣ Εταιρεία Bayer
ΠΟΣΑ ΜΦΙ ΓΙΑ 2012 780,31 €
2.2 Μελέτη των επιβλαβών οργανισμών, των μη παρασιτικών παθήσεων,
των διαδικασιών παθογένεσης καθώς και των μηχανισμών άμυνας των
φυτών
2.2.1 Ταυτοποίηση στελεχών Ωομυκήτων του γένους Phytophthora με μοριακές
μεθόδους
Οι ωομήκητες του γένους Phytophthora (Kingdom: Chromalveolata) περιλαμβάνουν ένα
σημαντικό αριθμό σοβαρών παθογόνων των φυτών και μελετούνται στο Εργαστήριο Μυκητολογίας
από την εποχή ιδρύσεώς του. Μέχρι σήμερα, η συστηματική κατάταξη των στελεχών της συλλογής
βασιζόταν στους καλλιεργητικούς και μορφομετρικούς χαρακτήρες των στελεχών καθώς και στο
βαθμό παθογένειας. Προκειμένου να εφαρμοστούν ασφαλέστερα κριτήρια για τον προσδιορισμό των
ειδών, τα τελευταία χρόνια το Εργαστήριο Μυκητολογίας εφαρμόζει μοριακές μεθόδους για την
επιβεβαίωση του χαρακτηρισμού των διαφόρων στελεχών της Συλλογής. Ως εκ τούτου και κατά το
έτος 2012 συνεχίστηκε η επανεξέταση των στελεχών των ωομυκήτων της συλλογής και η ταυτοποίησή
τους με τη μοριακή μέθοδο RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) (Cooke et al 2000). Η
συγκεκριμένη μέθοδος χρησιμοποιείται διεθνώς για την ταυτοποίηση 47 τουλάχιστον διαφορετικών
ειδών ωομυκήτων του γένους Phytophthora. Αρχικά εφαρμόζεται η μέθοδος της αλυσιδωτής
αντίδρασης πολυμεράσης (PCR) με τους εκκινητές (primers) ITS4 (5’-TCCTCCGCTTATTGATATGC-
3’) και ITS6 (5’-GAAGGTGAAGTCGTAACAAGG-3’). Στη συνέχεια γίνεται πέψη του προϊόντος της
PCR με τα ένζυμα περιορισμού TaqI, MspI και AluI και εξετάζεται το μήκος των θραυσμάτων DNA που
προκύπτουν. Σε επόμενο στάδιο τα προϊόντα της PCR θα χρησιμοποιηθούν για την ανάλυση της
αλληλουχίας των βάσεων.
ΤΜΗΜΑ Φυτοπαθολογίας
ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΟ Μυκητολογίας
ΥΠΕΥΘΥΝΟΣ ΕΡΓΟΥ Δρ Ε. Βλουτόγλου
ΕΜΠΛΕΚΟΜΕΝΟ ΠΡΟΣΩΠΙΚΟ Δ. Τσιρογιάννης, Ε. Καλογεροπούλου, Σ.
Μιγκάρδου
ΔΙΑΡΚΕΙΑ ΕΡΓΟΥ Συνεχιζόμενο μέχρι 31.12.2013
ΚΑΛΥΨΗ ΔΑΠΑΝΗΣ 100% ΜΦΙ
2.2.2 Βελτιστοποίηση της παραγωγής υγιούς πολλαπλασιαστικού υλικού
οπωροφόρων δένδρων με σύγχρονες βιολογικές και βιοτεχνολογικές
μεθόδους (ΒΙΟΚΑΡΠΟΣ)
α. Ανάπτυξη Multiplex Real time ΡΤ-PCR για ιούς, ιοειδή και φυτοπλάσματα μηλοειδών