Page 58 - ektheseis 2012

56
προϊόντος αυτού και σύγκριση της αλληλουχίας που προέκυψε με κατατεθειμένες νουκλεοτιδικές
αλληλουχίες ιών στη βάση δεδομένων NCBI. Από τη σύγκριση, προέκυψε ότι η αλληλουχία ανήκει
στον ιό DMV και συγκεκριμένα παρουσιάζει 99% ομοιότητα με αντίστοιχη αλληλουχία της
απομόνωσης D10 από τις ΗΠΑ (Acc. N. EU096522). Κατά τους Pappu et al. (2008), η απομόνωση
DMV-D10 θεωρείται διακριτός ιός από τον DMV και είναι αυτός που εμφανίζεται με τη μεγαλύτερη
συχνότητα στην καλλιέργεια ντάλιας στις ΗΠΑ. Είναι η πρώτη φορά που εντοπίστηκε ο ιός αυτός στη
χώρα μας και πειράματα παθογένειας σε φυτά ντάλιας βρίσκονται ακόμη σε εξέλιξη.
Το καλοκαίρι του 2012 σειρά δειγμάτων φυτών κολοκυθιάς υβρίδιο Rigas με έντονες
παραμορφώσεις φύλλων και εξογκώματα στους καρπούς παρελήφθησαν στο Εργαστήριο Ιολογίας
αρχικά από την περιοχή της Ηλείας ενώ ακολούθησαν κι άλλες παραλαβές παρόμοιων δειγμάτων και
από τη Μεσσηνία. Αρχικά τα δείγματα ελέγχθηκαν με τη μέθοδο ELISA για τους συνήθως
εμπλεκόμενους με τη σχετική συμπτωματολογία ιούς Cucumber mosaic virus, Zucchini yellow mosaic
virus και Watermelon mosaic virus και διαπιστώθηκε η εμφάνισή τους είτε σε μονές είτε σε μικτές
μολύνσεις. Τεχνητές μολύνσεις σε φυτά δείκτες στο θερμοκήπιο του εργαστηρίου έδειξαν ποικίλη
συμπτωματολογία ανάλογα με το δείγμα ενώ σε πολλές κολοκυθιές που χρησιμοποιήθηκαν σαν
δείκτες πραγματοποιήθηκε αναπαραγωγή των συμπτωμάτων των δειγμάτων. Επειδή το συγκεκριμένο
υβρίδιο κολοκυθιάς είναι ανεκτικό στους παραπάνω αναφερθέντες ιούς η διερεύνηση συνεχίστηκε με
την εφαρμογή της μεθόδου της RT-PCR σε παρασκευάσματα ολικού RNA προσβεβλημένων
δειγματων για εξειδικευμένη ανίχνευση του Moroccan watermelon mosaic virus (MWMV) με
δημοσιευμένους εκκινητές (Lecoq et al ., 2008). Σε όλα τα δείγματα παρατηρήθηκε προϊόν του
αναμενόμενου μεγέθους των 627 ζευγών βάσεων νουκλεοτιδίων. Στη συνέχεια το προϊόν
αλληλουχήθηκε και σε σύγκριση της αλληλουχίας που προέκυψε με κατατεθειμένες ιικές αλληλουχίες
στη βάση δεδομένων NCBI, απεδείχθει ότι η αλληλουχία ανήκει στον MWMV, γένος Potyvirus,
συγγενούς με τον WMV του ιδίου γένους. Συγκεκριμένα βρέθηκε ότι παρουσιάζει 96-98% ομοιότητα με
αντίστοιχες αλληλουχίες απομονώσεων του ΜWMV από την Τυνησία. Τέλος, πραγματοποιήθηκε
επιτυχώς δοκιμή ανίχνευσης του ιού με την μέθοδο της direct RT-PCR σε ομογενοποιημένο με νερό
ιστό φύλλων από φυτά κολοκυθιάς τεχνητώς μολυσμένα με τον ιό. Πρόκειται για εμφάνιση του ιού
αυτού στη χώρα μας για πρώτη φορά.
2.2.10 Development of Benaki Phytopathological Institute as a Centre of Excellence in
plant health and Crop protection (FP7-REGPOT-2008-1, No230010)
Διερεύνηση των διαδικασιών παθογένεσης με τη μελέτη των σχέσεων παθογόνου-
ξενιστή
1. Ιός Υ της πατάτας
Οι απομονώσεις του ιού Υ της πατάτας (Potato virus Y, PVY, γένος Potyvirus) ταξινομούνται
σε τέσσερις κύριες φυλογενετικές ομάδες O, N, C1 και C2. Από αυτές μόνο οι απομονώσεις της
ομάδας C1 μολύνουν διασυστηματικά το φυτό-ξενιστή πιπεριάς. Με στόχο την ταυτοποίηση των
περιοχών του γονιδιώματος του PVY που καθορίζουν την ικανότητα των απομονώσεων της ομάδας
ΤΜΗΜΑ Φυτοπαθολογίας
ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΟ Ιολογίας
ΥΠΕΥΘΥΝΟΣ ΕΡΓΟΥ Δρ Χ. Βαρβέρη
ΕΜΠΛΕΚΟΜΕΝΟ ΠΡΟΣΩΠΙΚΟ Δρ Ν. Βασιλάκος, Ι Μαλανδράκη,
Χ. Παναγιωτίδη
ΔΙΑΡΚΕΙΑ ΕΡΓΟΥ 2.1.2011 - 31.12.2013
ΚΑΛΥΨΗ ΔΑΠΑΝΗΣ 100% ΜΦΙ