Page 54 - ektheseis 2012

52
βακτήρια καραντίνας ή μη, τα οποία προκαλούν οικονομικής σημασίας ζημία στις γεωργικές
καλλιέργειες. Στο πλαίσιο αυτό, συνεχίστηκε η βελτιστοποίηση της μεθόδου μοριακής ανίχνευσης και
ταυτοποίησης του παθογόνου Pseudomonas syringae pv. actinidiae, με εφαρμογή νέου πρωτοκόλλου
PCR το οποίο είχε παρόμοια ευαισθησία αλλά μεγαλύτερη εξειδίκευση σε σχέση με το ήδη
εφαρμοζόμενο στο Εργαστήριο. Η μέθοδος αυτή θα χρησιμοποιηθεί συμπληρωματικά στο πρόγραμμα
επισκόπησης των καλλιεργειών ακτινιδιάς στη Χώρα.
Παράλληλα συνεχίστηκε η από ετών συντελούμενη μελέτη των στελεχών Ralstonia solanacearum, τα
οποία είχαν απομονωθεί από ασθενή φυτά τομάτας, κονδύλους πατάτας, καθώς και από δείγματα
επιφανειακών νερών, που εξετάστηκαν στο Εργαστήριο. Η μελέτη περιέλαβε μοριακό χαρακτηρισμό των
βακτηριακών στελεχών με σύγκριση των γενετικών αποτυπωμάτων τους με πρότυπα στελέχη
διαφορετικών βιοτύπων Rasltonia solanacearum. Κατά την ίδια χρονική περίοδο, συνεχίστηκε η μελέτη
στελεχών των πηκτινολυτικών βακτηρίων Erwinia carotovora subsp. carotovora (συν. Pectobacterium
carotovorum) τα οποία απομονώθηκαν από φυτά πατάτας και κουνουπιδιού καθώς και στελεχών Erwinia
chrysanthemi (συν. Dickeya spp.) από φυτά αραβόσιτου. Επίσης στελέχη του βακτηρίου Pseudomonas
tolaasii, που είχαν απομονωθεί στο Εργαστήριο από δείγματα προσβεβλημένων μανιταριών Pleurotus sp.,
προερχόμενων από εμπορικές μονάδες καλλιέργειας στους Νομούς Αργολίδας και Λασιθίου, μελετήθηκαν
ως προς το μεταβολικό προφίλ τους (δυνατότητα μεταβολισμού 71 πηγών άνθρακα και χημική ευαισθησία
σε 23 χημικές ουσίες) χρησιμοποιώντας πλάκες μικροτιτλοδότησης. Τα μέχρι τώρα αποτελέσματα έδειξαν
σχετική ομοιογένεια των υπό μελέτη βακτηριακών στελεχών.
Την περίοδο Μαρτίου-Μαΐου 2012, απομονώθηκαν στο Εργαστήριο νέα στελέχη του γένους
Acidovorax από δείγματα νεαρών σποροφύτων καρπουζιάς, πεπονιάς και αγγουριάς θερμοκηπιακής
εμπορικής καλλιέργεια, τα οποία έφεραν νεκρωτικές κηλίδες, μεμονωμένες ή/και συνενωμένες,
καστανού χρώματος, ακανονίστου σχήματος, με χλωρωτική άλω στις περισσότερες περιπτώσεις. Οι
κηλίδες παρατηρήθηκαν στις κοτυληδόνες των φυτών καρπουζιάς, πεπονιάς και αγγουριάς καθώς και
σε περιορισμένο αριθμό πραγματικών φύλλων των φυτών πεπονιάς. Σύμφωνα με τα πληροφοριακά
δελτία των δειγμάτων ο αριθμός των προσβεβλημένων φυτών κυμάνθηκε σε ποσοστό 10% έως 100%
των φυτών της καλλιέργειας. Σε όλα τα δείγματα, η μικροσκοπική εξέταση τομών προσβεβλημένων
ιστών έδειξε την παρουσία μεγάλου πληθυσμού βακτηρίων εξερχομένων από τα σημεία τομής. Από
τους ιστούς αυτούς απομονώθηκε σταθερά σε καθαρή καλλιέργεια, βακτήριο το οποίο, βάσει
καλλιεργητικών, βιοχημικών, ανοσολογικών δοκιμών και δοκιμής αντίδρασης υπερευαισθησίας στον
καπνό, ταυτοποιήθηκε ως φυτοπαθογόνο στέλεχος του γένους Acidovorax. Αλληλούχηση τμήματος
της περιοχής 16S rDNA του απομονωθέντος στελέχους έδειξε σημαντική ομοιότητα με το είδος A.
valerianellae, ενώ μοριακές δοκιμές PCR έδειξαν ότι το στέλεχος διαφέρει από τυπικά στελέχη
αναφοράς A. citrulli. Η περαιτέρω ταυτοποίηση του βακτηρίου σε επίπεδο είδους συνεχίζεται.
ΤΜΗΜΑ Φυτοπαθολογίας
ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΟ Βακτηριολογίας
ΥΠΕΥΘΥΝΟΣ ΕΡΓΟΥ Δρ Μ.Κ. Χολέβα
ΕΜΠΛΕΚΟΜΕΝΟ ΠΡΟΣΩΠΙΚΟ Π.Ε. Γλυνός, Χ. Καράφλα, Σ. Δρακούλης
ΔΙΑΡΚΕΙΑ ΕΡΓΟΥ 2010 - 2013
ΚΑΛΥΨΗ ΔΑΠΑΝΗΣ 100% ΜΦΙ
2.2.4 Μελέτη της ανθεκτικότητας ποικιλιών αμυγδαλιάς στο φυτοπαθογόνο βακτήριο
Pseudomonas amygdali.
Κατά τα έτoς 2012, συνεχίστηκε για τέταρτη χρονιά η παρακολούθηση της εξέλιξης των
συμπτωμάτων σε δενδρύλλια αμυγδαλιάς τεσσάρων καλλιεργούμενων ποικιλιών (Αλκυών,
Ραπτοπούλου, Ferragnes, Lauranne) εμβολιασμένων σε άγριο υποκείμενο πικραμυγδαλιάς, που είχαν