Page 55 - ektheseis 2012

53
μολυνθεί τεχνητά το 2009 με το φυτοπαθογόνο βακτήριο Pseudomonas amygdali, που προκαλεί την
ασθένεια ‘Υπερπλαστικό Έλκος’ της αμυγδαλιάς. Συγκεκριμένα, τα δενδρύλλια επιθεωρούνταν για την
εμφάνιση και ανάπτυξη (μορφολογία, μήκος x πλάτος) των ελκών στα σημεία των μολύνσεων ή σε
άλλα σημεία των κλάδων και του κορμού. Οι ποικιλίες Ferragnes και Ραπτοπούλου συνέχισαν να
δείχνουν πιο ευπαθείς σε σχέση με τις άλλες δύο ποικιλίες, Αλκυών και Laurenne, όπως και την
πρώτη χρονιά της μόλυνσης. Οι παρατηρήσεις επί της εξέλιξης των συμπτωμάτων συνεχίζονται.
ΤΜΗΜΑ Φυτοπαθολογίας
ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΟ Βακτηριολογίας
ΥΠΕΥΘΥΝΟΣ ΕΡΓΟΥ Δρ Μ.Κ. Χολέβα
ΕΜΠΛΕΚΟΜΕΝΟ ΠΡΟΣΩΠΙΚΟ Π.Ε. Γλυνός, Χ. Καράφλα, Σ. Δρακούλης
ΔΙΑΡΚΕΙΑ ΕΡΓΟΥ 2009 - 2013
ΚΑΛΥΨΗ ΔΑΠΑΝΗΣ 100% ΜΦΙ
2.2.5 Απομόνωση και αλληλούχιση γονιδίων του εκκριτικού συστήματος VI των
φυτοπαθογόνων βακτηρίων
Τα εκκριτικά συστήματα τύπου VI (Type VI secretion systems, σύντμηση σε T6SS) των Gram-
βακτηρίων σχηματίζουν βελονοειδής δομές για τη μεταφορά πρωτεινών τελεστών, απευθείας στο
κυτταρόπλασμα των ξενιστών τους. Βιοπληροφορική (In silico) ανάλυση έξι γονιδιωμάτων των
παθοτύπων του είδους Pseudomonas syringae και συγκεκριμένα των P. syringae pv. tomato DC3000, pv.
tabaci ATCC 11528, pv. tomato T1 και pv. oryzae 1-6. Το τελευταίο φέρει δύο πιθανές νησίδες
παθογένειας T6SS (HSI-I και HSI-II; HSI: αντιστοιχεί σε Hcp secretion island), ενώ οι παθότυποι P.s. pv
phaseolicola 1448A και pv. syringae B728 από μία. Τα T6SS P.s. pv. tomato DC3000 HSI-I και pv. tomato
T1 HSI-II παρουσιάζουν παρόμοια οργάνωση στα ρυθμιζόνια και νουκλεοτιδικές αλληλουχίες, ενώ το pv.
tomato DC3000, pv. oryzae 1-6 και pv. tabaci 11528 HSI-II παρουσιάζουν παραλλακτικότητα σε σχέση με
τα υπόλοιπα. Οι πιθανοί ορθόλογοι τελεστές σε κάθε νησίδα παθογένειας διαφέρουν σε κάθε στέλεχος. Οι
πρωτείνες τύπου Clp-ATPάσες και ομόλογες των IcmF διαφοροποιούνται σε δύο μη συγγενικές
φυλογενετικές ομάδες: αυτές των pv. tomato DC3000, pv. tomato T1, pv. oryzae και pv. tabaci 11528 από
την ομάδα ΗSI-II κατατάσσονται μαζί με τα περισσότερα ορθόλογα από άλλες φθορίζουσες
Ψευδομονάδες. Αντίθετα, αυτές των pv. syringae, pv. tabaci, pv. tomato T1 και pv. oryzae από την ομάδα
HSI-I κατατάσσονται ως συγγενικές των Ralstonia solanacearum και Xanthomonas. Η ανάλυση
υποδεικνύει πολλαπλές και ανεξάρτητες οριζόντιες μεταφορές γονιδίων του εκκριτικού συστήματος τύπου
VI τόσο ως προς την ενσωμάτωση, όσο και προς την εκδίωξη από διαφορετικά στελέχη και παθότυπους
του είδους P. syringae.
ΤΜΗΜΑ Φυτοπαθολογίας
ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΟ Βακτηριολογίας
ΥΠΕΥΘΥΝΟΣ ΕΡΓΟΥ Δρ Ν.Ι. Σκανδάλης
ΕΜΠΛΕΚΟΜΕΝΟ ΠΡΟΣΩΠΙΚΟ Χ. Καράφλα, Π.Ε. Γλυνός
ΣΥΜΜΕΤΕΧΟΝΤΕΣ ΦΟΡΕΙΣ Τμήμα Βιολογίας Πανεπιστήμιου Κρήτης
ΔΙΑΡΚΕΙΑ ΕΡΓΟΥ 1.1.2011 – 31.8.2013
ΚΑΛΥΨΗ ΔΑΠΑΝΗΣ ΜΦΙ (για εργασίες του Ινστιτούτου)
2.2.6 Χρησιμοποίηση βακτηριακών στελεχών για την παραγωγή dsRNA του
γονιδίου της καψιδιακής πρωτεΐνης του ιού του μωσαϊκού της αγγουριάς
(Cucumber mosaic virus) και αξιολόγηση της δράσης του παραγόμενου dsRNA