43
Σ
ΧΕΤΙΚΗ
Ε
ΝΟΤΗΤΑ
«Π
ΡΟΓΡΑΜΜΑΤΑ
»
3.4
2.3.7 Μελέτη της ανθεκτικότητας ποικιλιών αμυγδαλιάς στο φυτοπαθογόνο βακτήριο
Pseudomonas amygdali
Συνεχίστηκε για έβδομη συνεχή χρονιά η παρακολούθηση της εξέλιξης των συμπτωμάτων της
ασθένειας «Υπερπλαστικό έλκος της αμυδγαλιάς» σε δενδρύλλια αμυγδαλιάς τεσσάρων ποικιλιών:
Αλκυών, Ραπτοπούλου, Ferragnes και Lauranne εμβολιασμένων σε άγριο υποκείμενο
πικραμυγδαλιάς. Τα δενδύλλια είχαν εγκατασταθεί σε γλάστρες και είχαν μολυνθεί τεχνητώς το έτος
2009 με στέλεχος του φυτοπαθογόνου βακτηρίου
Pseudomonas amygdali
προερχόμενο από τη
συλλογή του Εργαστηρίου Βακτηριολογίας (BPIC). Tα δενδρύλλια επιθεωρούνταν για την εμφάνιση
και ανάπτυξη (μορφολογία, μήκος x πλάτος) των ελκών στα σημεία των μολύνσεων ή σε άλλα σημεία
των κλάδων και του κορμού. Κατά το έτος 2015, οι ποικιλίες Ferragnes και Ραπτοπούλου συνέχισαν
να δείχνουν πιο ευπαθείς σε σχέση με τις άλλες δύο ποικιλίες, Αλκυών και Lauranne. Παράλληλα,
συνεχίστηκε η διερεύνηση για τον εντοπισμό και μοριακό χαρακτηρισμό γονιδίων παθογένειας του
βακτηρίου.
In silico
ανάλυση των αποτελεσμάτων νέας γενιάς αλληλούχησης για το βακτηριακό
στελέχος που χρησιμοποιήθηκε στις τεχνητές μολύνσεις είναι υπό εξέλιξη. Από την ανάλυση αυτή
αναμένεται να προκύψουν χρήσιμα συμπεράσματα για το μηχανισμό παθογένειας του βακτηρίου, τα
οποία θα συμβάλλουν στην καλύτερη κατανόηση των αλληλεπιδράσεών του με το φυτό ξενιστή
(αμυγδαλιά), και στο σχεδιασμό νέων μεθόδων καταπολέμησής του.
Τ
ΜΗΜΑ
Φυτοπαθολογίας
Ε
ΡΓΑΣΤΗΡΙΟ
Βακτηριολογίας
Υ
ΠΕΥΘΥΝΟΣ
Ε
ΡΓΟΥ
Δρ Μ.Κ. Χολέβα
Ε
ΜΠΛΕΚΟΜΕΝΟ
Π
ΡΟΣΩΠΙΚΟ
Π.Ε. Γλυνός, Χ. Καράφλα, Σ. Δρακούλης
Δ
ΙΑΡΚΕΙΑ
Ε
ΡΓΟΥ
2009 - 2015
Κ
ΑΛΥΨΗ
Δ
ΑΠΑΝΗΣ
100% ΜΦΙ
2.3.8 Μελέτη ασθενειών οικονομικής σημασίας γεωργικών καλλιεργειών ως προς τη
διάγνωση ή/και την παραλλακτικότητα των παθογόνων βακτηρίων που τις
προκαλούν, με έμφαση σε εκείνες τις ασθένειες που οφείλονται στα
Pseudomonas syringae
pv.
actinidiae, Ralstonia solanacearum,
πηκτινολητικά
είδη του γένους
Erwinia, Pseudomonas tolaasii, Acidovorax citrulli,
Pseudomonas viridiflava
Πρόκειται για συνεχιζόμενο ερευνητικό Πρόγραμμα του Εργαστηρίου Βακτηριολογίας που καλύπτει
άμεσες ανάγκες απόκτησης στοχευμένων γνώσεων σε θέματα διάγνωσης, επιδημιολογίας και
αντιμετώπισης ασθενειών από προκαρυωτικά παθογόνα με ιδιαίτερο ενδιαφέρον για την ελληνική γεωργία.
Κατά το έτος 2015 συνεχίστηκε η μελέτη επί στελεχών των φυτοπαθογόνων βακτηρίων
Pseudomonas
syringae
pv.
actinidiae
,
Acidovorax citrulli
και πηκτινολητικών ειδών του γένους
Erwinia
(
Pecto-
bacterium
/
Dickeya
), που είτε έχουν απομονωθεί από δείγματα ασθενών φυτών στο Εργαστήριο
Βακτηριολογίας του ΜΦΙ, είτε έχουν αποκτηθεί από αντίστοιχα εργαστήρια στο εξωτερικό και συλλογές
μικροοργανισμών. Ειδικότερα, συλλέχθηκαν νέα στελέχη του παθογόνου βακτηρίου
Pseudomonas
syringae
pv.
actinidiae
που απομονώθηκαν από δείγματα ασθενών φυτών ακτινιδιάς και ταυτοποιήθηκαν
με βάση τη μορφολογία των αποικιών τους σε τεχνητά θρεπτικά υλικά, τα βιοχημικά χαρακτηριστικά τους
που προσδιορίστηκαν με κατάλληλες μικροβιολογικές δοκιμές, τα μοριακά χαρακτηριστικά τους
συμπεριλαμβανομένου του γενετικού αποτυπώματός τους (genomic fingerprinting), καθώς και δοκιμές
παθογένειας σε φυτά ακτινιδιάς. Η μελέτη θα συνεχιστεί για περαιτέρω χαρακτηρισμό των ελληνικών