44
στελεχών σε γενωμικό επίπεδο. Παράλληλα συλλέχθηκαν νέα στελέχη
Acidovorax
citrulli
τα οποία
απομονώθηκαν από ασθενή φυτά καρπουζιάς, πηκτινολυτικά βακτήρια του γένους
Erwinia
τα οποία
απομονώθηκαν από φυτά πατάτας, καθώς και στελέχη
Xanthomonas euvesicatoria
από φυτά πιπεριάς.
Τα στελέχη αυτά θα προστεθούν στα προϋπάρχοντα που μελετώνται ως προς την γενετική
παραλλακτικότητά τους.
Τ
ΜΗΜΑ
Φυτοπαθολογίας
Ε
ΡΓΑΣΤΗΡΙΟ
Βακτηριολογίας
Υ
ΠΕΥΘΥΝΟΣ
Ε
ΡΓΟΥ
Δρ Μ.Κ. Χολέβα
Ε
ΜΠΛΕΚΟΜΕΝΟ
Π
ΡΟΣΩΠΙΚΟ
Π. Γλυνός, Χ. Καράφλα, Σ. Δρακούλης
Δ
ΙΑΡΚΕΙΑ
Ε
ΡΓΟΥ
2010 - 2015
Κ
ΑΛΥΨΗ
Δ
ΑΠΑΝΗΣ
100% ΜΦΙ
2.3.9 Μελέτη νεοεμφανιζόμενων ιώσεων και ανάπτυξη σύγχρονων μεθόδων
ανίχνευσης των συσχετιζόμενων στελεχών και ιών
Έγινε αναπαραγωγή συμπτωμάτων του ιού του μωσαϊκού του είδους
Hippeastrum
(
Hippeastrum
mosaic virus
, HiMV, γένος
Potyvirus
), που διαπιστώθηκε για πρώτη φορά στη χώρα μας το 2014, με
τεχνητές μολύνσεις φυτών
Hippeastrum
για την ολοκλήρωση του προσδιορισμού του ιού.
Βολβοί του
ανωτέρω είδους φυτεύθηκαν και τα πρώτα εκτυχθέντα φύλλα εξετάστηκαν για τυχόν προσβολή από τους
σπουδαιότερους ιούς του είδους με τη μέθοδο ELISA για τους
Cucumber mosaic virus
,
Tomato ringspot
virus
,
Tomato spotted wilt virus
και
Groundnut ringspot viru
s και με τη μέθοδο RT-PCR για τον HiMV. Ο
έλεγχος ήταν αρνητικός για την παρουσία των ιών αυτών, οπότε ακολούθησε τεχνητή μόλυνση των φυτών
με τη μέθοδο του φυλλικού δίσκου. Δυο εβδομάδες αργότερα τα φυτά εμφάνισαν τυπικά συμπτώματα της
ασθένειας που προκαλεί ο HiMV και μοριακός έλεγχος αυτών με RT-PCR επιβεβαίωσε την παρουσία του.
Με αυτόν τον τρόπο ικανοποιήθηκαν όλοι οι κανόνες του Κωχ και απεδείχθει ότι ο ιός είναι το παθογόνο
αίτιο της ίωσης που διαπιστώθηκε για πρώτη φορά στη χώρα μας το 2014 σε φυτά
Hippeastrum
sp. (κν.
αμαρυλλίς) από φυτωριακή εγκατάσταση στην Αττική. Από την εργασία αυτή προέκυψε η δημοσίευση
(Βλ. Δημοσιεύσεις).
Τ
ΜΗΜΑ
Φυτοπαθολογίας
Ε
ΡΓΑΣΤΗΡΙΟ
Ιολογίας
Υ
ΠΕΥΘΥΝΟΣ
Ε
ΡΓΟΥ
Δρ Χ. Βαρβέρη
Ε
ΜΠΛΕΚΟΜΕΝΟ
Π
ΡΟΣΩΠΙΚΟ
Δρ Ν. Βασιλάκος, Ι. Μαλανδράκη
Δ
ΙΑΡΚΕΙΑ
Ε
ΡΓΟΥ
2.1.2011 - 31.12.2015
Κ
ΑΛΥΨΗ
Δ
ΑΠΑΝΗΣ
100% ΜΦΙ
2.3.10 Μελέτη της προσαρμογής του ιού Υ της πατάτας (
Potato virus Y
, PVY) στο
φυτό-ξενιστή πιπεριά
Οι απομονώσεις του ιού Υ της πατάτας
(
Potato virus Y
, PVY, γένος
Potyvirus
), ταξινομούνται σε
τέσσερις κύριες φυλογενετικές ομάδες O, N, C1 και C2. Από αυτές μόνο οι απομονώσεις της ομάδας
C1 μολύνουν διασυστηματικά το φυτό-ξενιστή πιπεριά. Βιολογικός χαρακτηρισμός σειράς
ανασυνδυασμένων μολυσματικών ιϊκών κλώνων μεταξύ των απομονώσεων PVY-C1, PVY-N και PVY-
C2, κατέδειξε την κωδική περιοχή P3 σαν εκείνη που καθορίζει τη μολυσματικότητα του ιού στην
πιπεριά
και δευτερευόντως τη περιοχή CI. Επιπλέον, πειράματα εξέλιξης έδειξαν ότι η ανάκτηση της
μολυσματικότητας σε φυτά πιπεριάς ορισμένων ανασυνδυασμένων ιών σχετίζεται με μονές
αντικαταστάσεις αμινοξέων στη περιοχή P3. Κατευθυνόμενη μεταλαξογένεση σε συνδιασμό με δυο
επιπλέον αναλυτικές μεθόδους [θετική επιλογή (positive selection) και locus by locus analysis of
